157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2763 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  100 
 
 		 459 aa  956    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  66.97 
 
 		 443 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  66.82 
 
 		 446 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  66.82 
 
 		 446 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  66.82 
 
 		 464 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  66.29 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  65.91 
 
 		 446 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  65.53 
 
 		 443 aa  591  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  65.61 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  64.93 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  64.48 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  64.03 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  57.67 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  57.75 
 
 		 443 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  60.05 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  58.31 
 
 		 440 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  58.31 
 
 		 440 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  58.31 
 
 		 440 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  58.31 
 
 		 440 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  57.21 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  56.98 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  57.21 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  58.39 
 
 		 438 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  57.21 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  58.31 
 
 		 440 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  56.98 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  57.21 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  57.21 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  59.95 
 
 		 461 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  56.4 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  55.01 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  56.31 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  54.77 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  54.98 
 
 		 441 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  56.36 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  56.98 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  55.96 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  55.73 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  56.58 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  56.12 
 
 		 438 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  55.63 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  58.41 
 
 		 422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  53.47 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  56.03 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  51.36 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  46.74 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  47.62 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  50.51 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  45.07 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  46.19 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  47.65 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  46.26 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  43.87 
 
 		 473 aa  362  8e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  47.35 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  44.7 
 
 		 444 aa  342  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  43.72 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  46.92 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  47.03 
 
 		 445 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  46.76 
 
 		 445 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  51.85 
 
 		 283 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  52.04 
 
 		 282 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  62 
 
 		 110 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  23.6 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  34 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  21.32 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  22.5 
 
 		 505 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  23.04 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  23.46 
 
 		 320 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  25.08 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  26.46 
 
 		 290 aa  53.9  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  22.76 
 
 		 328 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  23.43 
 
 		 414 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  22.41 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  20.56 
 
 		 507 aa  50.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  23.1 
 
 		 509 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  24.43 
 
 		 321 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  20.18 
 
 		 402 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  25.29 
 
 		 291 aa  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  26.1 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  22.83 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  22.25 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  22.33 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  26.44 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  40.28 
 
 		 155 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  40.28 
 
 		 155 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  23.44 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.64 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  24 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  25.99 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0589  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.34 
 
 		 325 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  22.67 
 
 		 510 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  22.78 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.8 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>