More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0204 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0204  type II secretion system protein E  100 
 
 
357 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2371  type II secretion system protein E  61.78 
 
 
348 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4374  comG operon protein 1  52.62 
 
 
348 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3985  comG operon protein 1  53.06 
 
 
347 aa  362  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0411911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4264  comG operon protein 1  53.2 
 
 
348 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4145  comG operon protein 1  53.06 
 
 
347 aa  359  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.501429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4466  ComG operon protein 1  53.06 
 
 
347 aa  359  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  51.9 
 
 
347 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4355  comG operon protein 1  52.33 
 
 
347 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3995  comG operon protein 1  52.19 
 
 
347 aa  355  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4321  comG operon protein 1  52.19 
 
 
347 aa  332  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  48.79 
 
 
571 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.58 
 
 
553 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.04 
 
 
558 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.98 
 
 
571 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.64 
 
 
520 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.13 
 
 
558 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  41.28 
 
 
560 aa  239  5e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.76 
 
 
871 aa  238  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
561 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.27 
 
 
520 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.27 
 
 
520 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  44.13 
 
 
557 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.2 
 
 
553 aa  235  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  41.82 
 
 
591 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  40.78 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  43.03 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  47.45 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.64 
 
 
520 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  42.86 
 
 
575 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  41.64 
 
 
514 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.71 
 
 
553 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.16 
 
 
599 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.22 
 
 
564 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  43.49 
 
 
598 aa  231  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
570 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.16 
 
 
599 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  44.68 
 
 
556 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.54 
 
 
561 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  44.33 
 
 
501 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.01 
 
 
570 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  43.73 
 
 
561 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  45.96 
 
 
417 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  35.92 
 
 
787 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  43.01 
 
 
583 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  40.84 
 
 
497 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  38.49 
 
 
371 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  43.96 
 
 
563 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
577 aa  228  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  37.08 
 
 
521 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.73 
 
 
558 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  37.08 
 
 
521 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  41.6 
 
 
474 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  37.08 
 
 
521 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 
507 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  37.08 
 
 
521 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  44.25 
 
 
563 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.55 
 
 
599 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  40.06 
 
 
505 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.55 
 
 
553 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  39.82 
 
 
503 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  42.65 
 
 
583 aa  227  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.8 
 
 
554 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  41.37 
 
 
583 aa  226  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  40.42 
 
 
497 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  36.24 
 
 
595 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  43.48 
 
 
580 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.62 
 
 
557 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  40.11 
 
 
471 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  36.8 
 
 
514 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  40.42 
 
 
497 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  40.42 
 
 
497 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  40.24 
 
 
497 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  38.6 
 
 
595 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
555 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
550 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.77 
 
 
561 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.77 
 
 
566 aa  226  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  44 
 
 
597 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  40.94 
 
 
498 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  41 
 
 
499 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  40.41 
 
 
497 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  38.82 
 
 
514 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.58 
 
 
561 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  40.49 
 
 
594 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 
463 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  41 
 
 
498 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  45.61 
 
 
548 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.96 
 
 
572 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  42.55 
 
 
585 aa  224  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  36.62 
 
 
523 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  41.32 
 
 
888 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  37.94 
 
 
521 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  41.92 
 
 
489 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  42.49 
 
 
562 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  43.57 
 
 
573 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  40.41 
 
 
497 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  37.65 
 
 
521 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  40.41 
 
 
497 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  40.71 
 
 
499 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>