More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1966 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  54.77 
 
 		 647 aa  669    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  52.17 
 
 		 640 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  49.69 
 
 		 657 aa  635    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  76.52 
 
 		 645 aa  1038    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  77.85 
 
 		 644 aa  1056    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  56.92 
 
 		 645 aa  702    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  54.21 
 
 		 652 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  55.19 
 
 		 659 aa  706    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  96.6 
 
 		 648 aa  1279    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  57.83 
 
 		 660 aa  755    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  52.89 
 
 		 661 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  65.26 
 
 		 644 aa  876    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  75.27 
 
 		 648 aa  1024    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  100 
 
 		 648 aa  1318    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  57.52 
 
 		 641 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  56.92 
 
 		 645 aa  702    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  54.98 
 
 		 668 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  53.98 
 
 		 649 aa  724    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  49.77 
 
 		 644 aa  640    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  53.16 
 
 		 660 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  53.89 
 
 		 656 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  56.01 
 
 		 643 aa  738    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  50.93 
 
 		 646 aa  641    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  54.69 
 
 		 655 aa  714    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  67.39 
 
 		 645 aa  892    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  55.75 
 
 		 647 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  54.59 
 
 		 644 aa  678    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  54.29 
 
 		 642 aa  714    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  73.87 
 
 		 646 aa  996    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  52.4 
 
 		 642 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  52.09 
 
 		 674 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  55.62 
 
 		 639 aa  700    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  53.91 
 
 		 640 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  55.9 
 
 		 642 aa  727    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  51.48 
 
 		 643 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  49.46 
 
 		 656 aa  634  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  48.29 
 
 		 657 aa  625  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  49.84 
 
 		 642 aa  622  1e-177  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  51.25 
 
 		 641 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  49.16 
 
 		 661 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  48.22 
 
 		 658 aa  598  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  50.7 
 
 		 641 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  35.08 
 
 		 755 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  34.84 
 
 		 796 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  34.99 
 
 		 755 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  33.98 
 
 		 755 aa  346  7e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  33.98 
 
 		 754 aa  346  8e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  34.02 
 
 		 756 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  33.93 
 
 		 760 aa  344  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  33.94 
 
 		 770 aa  336  7e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  34.3 
 
 		 792 aa  333  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  33.33 
 
 		 758 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  33.81 
 
 		 757 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  33.97 
 
 		 755 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  34.2 
 
 		 780 aa  316  8e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  32.84 
 
 		 765 aa  316  9e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  33.47 
 
 		 798 aa  310  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  32.88 
 
 		 787 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  33.38 
 
 		 751 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  31.92 
 
 		 800 aa  308  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  35.05 
 
 		 783 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.23 
 
 		 418 aa  259  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.23 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  29.82 
 
 		 655 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  36.58 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.73 
 
 		 418 aa  240  5e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  34.84 
 
 		 418 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  33.17 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.86 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.73 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.97 
 
 		 420 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.21 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.83 
 
 		 424 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  26.03 
 
 		 763 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.73 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.48 
 
 		 420 aa  218  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  35.25 
 
 		 417 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.14 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.78 
 
 		 419 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.78 
 
 		 417 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  34.92 
 
 		 410 aa  214  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  38.12 
 
 		 416 aa  214  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.5 
 
 		 421 aa  213  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.93 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  28.24 
 
 		 677 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.32 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1133  hypothetical protein  26.94 
 
 		 783 aa  211  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  32.13 
 
 		 419 aa  210  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  37.74 
 
 		 423 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.84 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.61 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.52 
 
 		 424 aa  208  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.86 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.22 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.66 
 
 		 419 aa  207  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  25.93 
 
 		 753 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  25.93 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  25.93 
 
 		 753 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  26.21 
 
 		 753 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  34.91 
 
 		 424 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>