More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4687 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4687  major facilitator transporter  100 
 
 
479 aa  920    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652236  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
554 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  31.22 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
491 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  28.9 
 
 
523 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  30.42 
 
 
492 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
503 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  30.52 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  29.83 
 
 
650 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
492 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.13 
 
 
534 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  31.48 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  30.71 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  30.71 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  30.71 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  28.46 
 
 
457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 
539 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  27.64 
 
 
488 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  30.38 
 
 
487 aa  107  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 
449 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
474 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
485 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  26.76 
 
 
485 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  29.84 
 
 
491 aa  99  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 
526 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.49 
 
 
477 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
474 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  29.28 
 
 
511 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
512 aa  93.6  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  28.7 
 
 
500 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.08 
 
 
502 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 
592 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.54 
 
 
522 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
487 aa  90.5  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 
511 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 
511 aa  90.1  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  28.83 
 
 
511 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 
508 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.83 
 
 
511 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.51 
 
 
571 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  27.45 
 
 
476 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 
575 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  27.59 
 
 
535 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 
511 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 
511 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  27.39 
 
 
489 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  25.86 
 
 
464 aa  87.8  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 
522 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.41 
 
 
569 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.27 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.83 
 
 
511 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.83 
 
 
511 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.39 
 
 
520 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.83 
 
 
504 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.68 
 
 
565 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
484 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 
697 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 
524 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1748  major facilitator superfamily permease  32.24 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000637074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  30.86 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  30.26 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 
504 aa  81.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 
737 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04180  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08230)  29.17 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.46 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.76 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.22 
 
 
526 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
702 aa  80.1  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.09 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  28.15 
 
 
487 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  28.15 
 
 
487 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.7 
 
 
513 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.7 
 
 
513 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  28.42 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.88 
 
 
666 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  24.73 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.47 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.12 
 
 
685 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  24.7 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  24.47 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  24.7 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.7 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.7 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  25.51 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>