More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3601 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3601  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
497 aa  975    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.85 
 
 
547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.82 
 
 
550 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.04 
 
 
546 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  34.77 
 
 
547 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.14 
 
 
1004 aa  171  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.43 
 
 
538 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  35.31 
 
 
548 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.78 
 
 
538 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  34.77 
 
 
547 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.96 
 
 
538 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.66 
 
 
547 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.96 
 
 
538 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.78 
 
 
538 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.78 
 
 
538 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.95 
 
 
547 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1317  enterobactin synthase subunit E  30.92 
 
 
542 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0337644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.85 
 
 
547 aa  167  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.74 
 
 
538 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.74 
 
 
538 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.22 
 
 
549 aa  166  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.74 
 
 
538 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.82 
 
 
547 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.74 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  33.19 
 
 
638 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  27.67 
 
 
543 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1751  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.748681  normal  0.0123673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 
502 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.57 
 
 
538 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 
566 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
534 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
507 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 
534 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  29.89 
 
 
549 aa  160  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 
578 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.12 
 
 
549 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.76 
 
 
543 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
550 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.86 
 
 
540 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
550 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  30.04 
 
 
506 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.6 
 
 
547 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.14 
 
 
552 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1489  enterobactin synthase subunit E  32.2 
 
 
542 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
550 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.72 
 
 
543 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  29.69 
 
 
506 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  29.89 
 
 
519 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.38 
 
 
547 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 
504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  32.38 
 
 
687 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
487 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.01 
 
 
542 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
550 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  29.68 
 
 
519 aa  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  30.3 
 
 
511 aa  153  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  31.59 
 
 
509 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  29.13 
 
 
548 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4516  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
517 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385599  normal  0.236512 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
550 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
510 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  31.39 
 
 
537 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3420  enterobactin synthase subunit E  31.96 
 
 
542 aa  150  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195409  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
507 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 
546 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
973 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 
991 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
567 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  29.32 
 
 
555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  28.85 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.94 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  28.85 
 
 
566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  29.86 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2691  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382921  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  28.85 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01399  hypothetical protein  27.98 
 
 
539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  28.85 
 
 
566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0015  enterobactin synthase subunit E  28.22 
 
 
539 aa  148  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0649  enterobactin synthase subunit E  31.46 
 
 
536 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199158  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  35.23 
 
 
551 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 
552 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0754  enterobactin synthase subunit E  31.46 
 
 
536 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  32.93 
 
 
506 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0708  enterobactin synthase subunit E  31.46 
 
 
536 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0635  enterobactin synthase subunit E  31.46 
 
 
536 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
524 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  28.82 
 
 
536 aa  147  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
545 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2952  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
541 aa  147  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
501 aa  147  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  29.54 
 
 
539 aa  147  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 
541 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  29.9 
 
 
530 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>