136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3454 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  963    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  58.21 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  56 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  51.46 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  49.17 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  53.16 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  55.1 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  53.16 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  50.38 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  46.4 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  46.23 
 
 		 470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  45.04 
 
 		 482 aa  326  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  43.07 
 
 		 472 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  45.06 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  42.5 
 
 		 477 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  40.2 
 
 		 482 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  42.39 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  33.41 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  35.87 
 
 		 487 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  35.63 
 
 		 491 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  37.84 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  34.09 
 
 		 542 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  35.44 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  32.51 
 
 		 493 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  33.1 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  34.43 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  32.07 
 
 		 485 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.7 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  32.92 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  32.08 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  32.93 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  29.9 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  32.4 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  30.94 
 
 		 480 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  33.42 
 
 		 437 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  30.71 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  32.39 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  31.9 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  31.9 
 
 		 473 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  28.33 
 
 		 467 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  31.9 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  30.75 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  30.63 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  30.63 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  29 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  30.89 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  30.34 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  30.15 
 
 		 471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  31.34 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  30.73 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  30.28 
 
 		 798 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  33.18 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  31.46 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.66 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  32.43 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  31.83 
 
 		 482 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  29.15 
 
 		 480 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  30.86 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  30.86 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  30.86 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  30.86 
 
 		 480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  29.98 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  28.86 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.07 
 
 		 421 aa  140  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  31.31 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  28.99 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  29.06 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  28.67 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.88 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  26.05 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  29.37 
 
 		 488 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  26.27 
 
 		 484 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  25.48 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  27.25 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  28.86 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  26.99 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  24.04 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  25.91 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  29.34 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  38.22 
 
 		 200 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  28.53 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  29.39 
 
 		 449 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.32 
 
 		 482 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  28.11 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  25.37 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  23.12 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  25.81 
 
 		 435 aa  87.4  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  25.93 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  24.69 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  28.8 
 
 		 196 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  35.48 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  28.32 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  22.9 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  23.56 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  24.71 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>