More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1926 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  61.45 
 
 		 614 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  60.56 
 
 		 609 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  100 
 
 		 588 aa  1145    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  63.81 
 
 		 600 aa  687    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 590 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  57.31 
 
 		 615 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  61.05 
 
 		 609 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  60 
 
 		 620 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  58.76 
 
 		 593 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  58.52 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  58.59 
 
 		 589 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  57.37 
 
 		 590 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.5 
 
 		 635 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  56.62 
 
 		 581 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  53.91 
 
 		 593 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.57 
 
 		 618 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.53 
 
 		 626 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  44.9 
 
 		 615 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.38 
 
 		 1257 aa  331  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 1218 aa  326  8.000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 636 aa  319  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  38.94 
 
 		 619 aa  316  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  43.65 
 
 		 984 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.08 
 
 		 617 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.01 
 
 		 1522 aa  306  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.25 
 
 		 1436 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  35.61 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.43 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.43 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  37.41 
 
 		 1301 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 600 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 614 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.23 
 
 		 1284 aa  294  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  38.59 
 
 		 566 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 615 aa  292  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.97 
 
 		 602 aa  289  9e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.36 
 
 		 598 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  36.75 
 
 		 615 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30 
 
 		 597 aa  287  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.09 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 596 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.08 
 
 		 594 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  33.07 
 
 		 605 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  36.31 
 
 		 605 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.78 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  37.35 
 
 		 652 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  37.83 
 
 		 634 aa  279  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.95 
 
 		 567 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.31 
 
 		 572 aa  279  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.43 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.43 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  32.88 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.97 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.43 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.43 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 1332 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.8 
 
 		 576 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.21 
 
 		 575 aa  278  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.95 
 
 		 567 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 606 aa  276  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  31.34 
 
 		 593 aa  276  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.73 
 
 		 571 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 572 aa  276  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.2 
 
 		 571 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.43 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.24 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.3 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.2 
 
 		 1321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.82 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.55 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.55 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 		 598 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.11 
 
 		 587 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  29.57 
 
 		 587 aa  274  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.22 
 
 		 567 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  35.73 
 
 		 620 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  36.59 
 
 		 595 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  35.36 
 
 		 606 aa  273  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  33.79 
 
 		 608 aa  273  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  32.42 
 
 		 619 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  35.6 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.66 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  36.25 
 
 		 582 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.33 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  37.27 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 		 608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.98 
 
 		 614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.67 
 
 		 610 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.37 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.37 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.37 
 
 		 571 aa  270  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.3 
 
 		 609 aa  270  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  30.45 
 
 		 589 aa  269  8e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  36.25 
 
 		 582 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  30.43 
 
 		 602 aa  269  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>