More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4028 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  543  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.85 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  30.47 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  27.84 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  28.19 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  27.42 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.67 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  28.92 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.4 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  28.92 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  28.92 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  28.3 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.79 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  27.31 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.14 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  28.63 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  27.56 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  30.04 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  26.98 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  27.27 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  24.6 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  31.29 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 396 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.48 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.63 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.87 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  45.24 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.13 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>