201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3131 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 278 aa  517  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  68.95 
 
 		 275 aa  347  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.51 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.09 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.29 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.72 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.76 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.75 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  39.47 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.11 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.23 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.86 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.58 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.25 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  36.13 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  36.29 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.98 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  36.29 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  36.29 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.14 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.14 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  48 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.14 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  34.14 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.69 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  37.5 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.47 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  32.54 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.95 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.95 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.95 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.4 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.68 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.71 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.21 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.58 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.16 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.48 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.79 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  48.31 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.86 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.42 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.75 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.6 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.28 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  33.5 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  37.23 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  30.04 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  34.13 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.87 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.02 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.46 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  30.81 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.31 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.73 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  26.15 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.72 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.43 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.39 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.29 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.45 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.59 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.52 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.14 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.14 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.67 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  29.53 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.19 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.43 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.19 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.57 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  29.01 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  30.98 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  31.62 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.86 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.32 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.6 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.11 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.5 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.9 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.82 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.89 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  30.46 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.79 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.12 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.59 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  31.19 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>