More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1419 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  64.57 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  53.98 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  49.78 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  49.12 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  48.02 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  52.23 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  48 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  46.05 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  47.11 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  48.88 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  46.75 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  47.09 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  42.79 
 
 		 253 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  45.85 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  45.85 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  45.85 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  46.26 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  47.37 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.67 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  44.93 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  46.41 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  42.61 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  43.56 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  46.46 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  45.62 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  42.11 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  43.48 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  48.23 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  44.89 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  45.13 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  42.61 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  42.29 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  42.61 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  43.86 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  43.48 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  39.57 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  42.61 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  40.79 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  39.56 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  43.36 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  42.29 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  43.09 
 
 		 265 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  42.24 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  37.55 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  40.66 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  47.46 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  43.61 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  39.65 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  41.28 
 
 		 242 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  36.77 
 
 		 239 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  36.12 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  40.97 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  37.17 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  40.97 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  40.83 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  40.97 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  41.85 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.85 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  42.86 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  40.62 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.6 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  37.82 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  40.53 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  40.74 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  37.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  40.72 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  39.72 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  41.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  39.48 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  40.28 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  34.2 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  39.81 
 
 		 255 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  39.74 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.12 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.28 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  39.61 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  39.63 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  33.19 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  33.6 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  40.44 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  39.51 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  33.88 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.12 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.06 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  38.82 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  33.6 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  39.92 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  34.5 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  39.27 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.99 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.28 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>