103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0844 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0844  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0669  flagellar basal body L-ring protein-like protein  55.25 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0165935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1252  flagellar L-ring protein  36.87 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1203  flagellar L-ring protein  36.87 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0331  flagellar basal body L-ring protein-like protein  33.82 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  31.65 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  33.13 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  31.18 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  33.91 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  30.06 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  31.11 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  31.03 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  30.61 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  31.93 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  32.76 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  31.51 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  30.06 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  30.34 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  27.17 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  29.49 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  32.18 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  28.77 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  29.8 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  31.61 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  30.77 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  24.86 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  31.21 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  28.85 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  28.14 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  28.77 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  28.77 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  31.13 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  27.89 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  27.49 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  31.1 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  31.1 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  31.79 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  29.48 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  27.42 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  28.74 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  31.21 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  30.67 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  26.82 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  29.45 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  29.31 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  26.71 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  30.77 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  24.71 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  29.89 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  30.22 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  29.03 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  28.82 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  22.98 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  27.61 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  22.98 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  29.59 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  27.98 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  30.25 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  27.68 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  31.93 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  24.56 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  31.18 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  27.78 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  25.61 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  31.18 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  27.37 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  31.79 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  29.38 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  29.27 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  27.61 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  26.87 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  28.83 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  26.52 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  23.42 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  24.31 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  21.12 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  27.86 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  26.82 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  25.73 
 
 		 238 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  24.2 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  25.64 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  27.44 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  26.12 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  24.1 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0048  flagellar L-ring protein  23.87 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  28.12 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  26.58 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  28.22 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  27.04 
 
 		 235 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2235  flagellar L-ring protein  25.18 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>