More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4603 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4603  amidohydrolase  100 
 
 
427 aa  874    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  30.38 
 
 
480 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  31.15 
 
 
449 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  29.13 
 
 
466 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  29.9 
 
 
465 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  29.67 
 
 
465 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  28.5 
 
 
437 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  30.28 
 
 
459 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  31.38 
 
 
449 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  30.89 
 
 
431 aa  172  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  27.87 
 
 
435 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  28.95 
 
 
439 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  29.31 
 
 
435 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  28.95 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  28.76 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  31.49 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  28.6 
 
 
471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  31.45 
 
 
393 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  29.8 
 
 
390 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  32.32 
 
 
399 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  28.08 
 
 
471 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  30.17 
 
 
447 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  31.64 
 
 
390 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  29.88 
 
 
403 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  29.88 
 
 
403 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  29.57 
 
 
405 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.6 
 
 
438 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  30.03 
 
 
391 aa  159  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  28.38 
 
 
470 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  29.5 
 
 
400 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  30.39 
 
 
458 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  26.42 
 
 
436 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  29.57 
 
 
391 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1817  amidohydrolase  28.93 
 
 
429 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25204  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  29.97 
 
 
415 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  30.79 
 
 
399 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  30.65 
 
 
416 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  29.73 
 
 
405 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  27.46 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  31.17 
 
 
431 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  30.1 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  29.6 
 
 
438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  27.53 
 
 
389 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  28.08 
 
 
398 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  28.57 
 
 
403 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  28.03 
 
 
398 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  28.08 
 
 
398 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  27.41 
 
 
384 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  27.34 
 
 
404 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  30.02 
 
 
395 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  26.77 
 
 
382 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  28.03 
 
 
398 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  27.78 
 
 
386 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3241  peptidase M20D, amidohydrolase  27.66 
 
 
391 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0177418  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2995  amidohydrolase  26.97 
 
 
394 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.505357  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  29.32 
 
 
397 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  30.05 
 
 
388 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  27.21 
 
 
410 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  29.55 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  25.74 
 
 
407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  27.71 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  25.37 
 
 
385 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  28.82 
 
 
400 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  27.41 
 
 
389 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4387  peptidase M20D, amidohydrolase  26.92 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  29.93 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  26.65 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  25.19 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  26.7 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  29.13 
 
 
397 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  27.51 
 
 
397 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  26.65 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  26.65 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  25.45 
 
 
389 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  27.41 
 
 
387 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  26.74 
 
 
392 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  27.66 
 
 
387 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  28.18 
 
 
401 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  27.58 
 
 
388 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  26.4 
 
 
395 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  41.28 
 
 
387 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.29 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  27.55 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  26.29 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  31.02 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  26.62 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  26.23 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  26.29 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  28.68 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  25.85 
 
 
404 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  26.79 
 
 
402 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  27.66 
 
 
389 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  27.64 
 
 
393 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  26.29 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  28.3 
 
 
409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  26.29 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  28.08 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  26.29 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  26.29 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  28.17 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>