More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2906 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2906  response regulator receiver protein  100 
 
 		 517 aa  1047    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08151  response regulator  70.66 
 
 		 516 aa  773    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4282  PglZ domain protein  55.21 
 
 		 518 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.769544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5047  response regulator receiver protein  54.3 
 
 		 521 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1282  response regulator receiver protein  51.66 
 
 		 517 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00300616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3042  response regulator receiver protein  54.2 
 
 		 524 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1040  two-component response regulator  52.51 
 
 		 518 aa  557  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.429651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0928  response regulator  51.26 
 
 		 518 aa  519  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.581359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2518  response regulator receiver protein  44.51 
 
 		 519 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.487815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 230 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 157 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 151 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2693  response regulator  35.34 
 
 		 128 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0046  two-component response regulator AlgB  33.33 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 862 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5095  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.43 
 
 		 739 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.04 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.52 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  33.1 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0334  alginate biosynthesis transcriptional regulatory protein AlgB  33.62 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  33.1 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 223 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 234 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0133  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.59 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0263  helix-turn-helix, Fis-type  33.62 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0150  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  33.9 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  33.9 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  33.9 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.87 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.58 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  33.91 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  33.9 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  33.9 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  33.9 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  33.91 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  33.9 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0176  two-component response regulator AlgB  32.59 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1124  PglZ domain protein  25.22 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0434385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.41 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2720  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.54 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0240  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000039366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3781  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.77 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2666  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.13 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6282  two-component response regulator AlgB  30.37 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.15 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.62039e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 223 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 223 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  32.76 
 
 		 223 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  32.76 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  32.76 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4458  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  27.21 
 
 		 251 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  32.76 
 
 		 223 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.05 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.59 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1833  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.08 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.248577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.48 
 
 		 226 aa  73.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72380  two-component response regulator AlgB  30.47 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.415261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  32.76 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0638  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  33.06 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0427  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  28.97 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  32.76 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  32.76 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>