More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1940 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  81.22 
 
 		 229 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  77.97 
 
 		 232 aa  362  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 232 aa  351  5.9999999999999994e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  70.31 
 
 		 232 aa  340  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  72.44 
 
 		 232 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  69.43 
 
 		 232 aa  332  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  69 
 
 		 232 aa  327  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  65.33 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  60.83 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  59.45 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.01 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 233 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  58.06 
 
 		 229 aa  257  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  53.54 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 235 aa  255  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  60.37 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 234 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 231 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  57.6 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  58.45 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  51.8 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 235 aa  245  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 231 aa  244  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  51.34 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 233 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  51.33 
 
 		 259 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  52.25 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  52.89 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 234 aa  238  9e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  52 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  50.67 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0178  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0966549  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  51.53 
 
 		 229 aa  234  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  48.23 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  52.86 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  52.86 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 235 aa  231  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 235 aa  231  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>