178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1680 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.83 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.78 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.91 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.99 
 
 		 313 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.48 
 
 		 310 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.84 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.14 
 
 		 299 aa  124  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.76 
 
 		 304 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.07 
 
 		 319 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.24 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.24 
 
 		 303 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.91 
 
 		 311 aa  121  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.71 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.42 
 
 		 318 aa  118  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.55 
 
 		 343 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.7 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.29 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  35.67 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  34.12 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.02 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.23 
 
 		 328 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.98 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  34.29 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.72 
 
 		 309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  34.17 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.51 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.18 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.18 
 
 		 331 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.31 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.18 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.01 
 
 		 323 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.75 
 
 		 325 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.4 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.66 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 		 383 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.41 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  30.41 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  30.41 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  31.95 
 
 		 349 aa  99  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.36 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.85 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.58 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  30.77 
 
 		 377 aa  88.6  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  30.27 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  25.33 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  29.55 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.03 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.5 
 
 		 327 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.81 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  29.65 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.24 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.37 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.93 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.06 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.85 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.23 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  27.07 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.05 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.63 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  29.3 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  29.3 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  29.3 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.7 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  26.52 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1073  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  25.6 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  28.32 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13020  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  27.17 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13010  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.43 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 		 309 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  30.88 
 
 		 313 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  27.13 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  28.16 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2835  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  25.89 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.95 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4464  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.63 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  32.23 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  31.93 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0627  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.31 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.799522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  26.47 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  31.15 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  31.93 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  31.93 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  31.93 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.65 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  29.05 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4163  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.32 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  30.08 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.29 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  30.15 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  30 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  29 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  23.53 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>