More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0944 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0944  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  68.75 
 
 		 305 aa  424  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6500  porphobilinogen deaminase  52.43 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  61.25 
 
 		 288 aa  333  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  39.47 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  37.66 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  39.69 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  39.29 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  38.34 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  37.09 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  39.61 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  36.98 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  37.34 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  35.92 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  37.22 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  35.92 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  38.59 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  35.24 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  36.48 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  38.26 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  35.35 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  36.25 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  37.82 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  35.78 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  38.59 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  37.13 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  35.28 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  35.39 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  37.95 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  34.95 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  35.56 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  38.11 
 
 		 312 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  39.29 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  33.55 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  36.74 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  35.5 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  34.87 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  36.79 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  37.01 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  37.01 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  36.07 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  37.01 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  36.57 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  35.83 
 
 		 318 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  36.69 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  36.89 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  36.57 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  35.46 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  36.69 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  36.69 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  34.65 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  36.69 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  36.69 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  36.89 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  34.84 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  37.66 
 
 		 320 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  37.42 
 
 		 314 aa  185  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  38.63 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  35.08 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  36.57 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0963  porphobilinogen deaminase  37.25 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0492  hydroxymethylbilane synthase  37.14 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  36.25 
 
 		 309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  35.13 
 
 		 322 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  34.82 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  35.16 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  35.71 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  36.3 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  36.66 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  35.28 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  34.17 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  35.39 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  35.39 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  36.39 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  35.48 
 
 		 351 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  33.87 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  34.87 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  34.74 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  37.69 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  35.06 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  34.77 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  35.05 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  34.74 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  35.39 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  35.28 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  35.28 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  36.64 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  35.39 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  35.28 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>