More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0257 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0257  ABC transporter related  100 
 
 		 316 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02380  2-aminoethylphosphonate transport  46.82 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.174206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0555  ABC transporter related  46.43 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0413767  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3441  ABC transporter related  40.51 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0799  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2648  ABC transporter related  32.7 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  34.5 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2416  multiple sugar-binding ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.860941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  40.25 
 
 		 396 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.45 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.97 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2162  ABC transporter related  34.47 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.526088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  38.75 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  36.29 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  33.56 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  39.33 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  35.64 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  32.89 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  36.29 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  36.13 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  38.59 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  36.09 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  32.7 
 
 		 365 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 343 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  40.74 
 
 		 348 aa  165  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  35.02 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  32.27 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  34.64 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  35.39 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  35.27 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  36.07 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  35.71 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 366 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  35.66 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  35.59 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.89 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  39.38 
 
 		 355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1227  ABC transporter related  35.39 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000640126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  35.29 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  35.29 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.8 
 
 		 400 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  35.86 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  31.14 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  36.03 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  33.7 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.21 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  36.21 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.21 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  35.42 
 
 		 405 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  33.69 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  36.78 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  32.35 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  31.02 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.02 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.24 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  34.66 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  29.7 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  37.08 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  35.6 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 346 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  34.26 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.8 
 
 		 377 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  30.36 
 
 		 361 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  33.33 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  35.71 
 
 		 356 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  30.4 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  29.81 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  36.69 
 
 		 353 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  38.33 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  35.86 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3233  ABC transporter related  30.72 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.611679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.66 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  30.6 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  33.04 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.36 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.83 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>