More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0061 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0061  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
431 aa  899    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  56.15 
 
 
434 aa  502  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2087  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  52.87 
 
 
434 aa  472  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0527605  normal  0.0533895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4249  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.6 
 
 
442 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6960  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.97 
 
 
434 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.386716  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1958  deoxyribodipyrimidine photolyase (photoreactivating enzyme)  51.18 
 
 
433 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0029  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.32 
 
 
438 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919202  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.01 
 
 
477 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  42.98 
 
 
481 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.21 
 
 
497 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.88 
 
 
511 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.56 
 
 
493 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.55 
 
 
493 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.24 
 
 
488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.46 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  42.24 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.49 
 
 
492 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.26 
 
 
462 aa  352  8e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.03 
 
 
488 aa  352  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.43 
 
 
479 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4618  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.67 
 
 
515 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.62 
 
 
490 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.18 
 
 
499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1376  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.8 
 
 
492 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.79 
 
 
487 aa  335  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.56 
 
 
499 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0703  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.62 
 
 
525 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.34 
 
 
504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2745  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.11 
 
 
513 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.83 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.81 
 
 
491 aa  319  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0565  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.95 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470462  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0617  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.78 
 
 
518 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00814306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.23 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.85 
 
 
486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.14 
 
 
475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.51 
 
 
479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.81 
 
 
481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.59 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.71 
 
 
483 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.83 
 
 
478 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.53 
 
 
474 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.75 
 
 
466 aa  293  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  38.62 
 
 
474 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.39 
 
 
475 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.34 
 
 
445 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.6 
 
 
470 aa  286  5e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.43 
 
 
479 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.9 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  35.65 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  35.46 
 
 
471 aa  283  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.84 
 
 
452 aa  282  9e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0529  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.93 
 
 
421 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0312273  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1437  DNA photolyase FAD-binding  31.3 
 
 
514 aa  279  6e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  37.13 
 
 
478 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.9 
 
 
470 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.19 
 
 
468 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.6 
 
 
434 aa  275  9e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  34.11 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.6 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.35 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  33.68 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.89 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.19 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  36.53 
 
 
477 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.19 
 
 
484 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  33.26 
 
 
476 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  33.54 
 
 
476 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.19 
 
 
469 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.76 
 
 
471 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.64 
 
 
476 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.15 
 
 
472 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.64 
 
 
469 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  33.54 
 
 
479 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  34.94 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.94 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35 
 
 
478 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.08 
 
 
445 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.26 
 
 
497 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.08 
 
 
445 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.08 
 
 
445 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.06 
 
 
493 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.36 
 
 
449 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.94 
 
 
472 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.43 
 
 
476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.03 
 
 
499 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.98 
 
 
471 aa  269  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.77 
 
 
486 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.43 
 
 
476 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.68 
 
 
500 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  33.76 
 
 
483 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.82 
 
 
463 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.84 
 
 
481 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.29 
 
 
474 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  34.26 
 
 
469 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.61 
 
 
499 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.83 
 
 
453 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.58 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.58 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.82 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>