275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4273 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  100 
 
 
670 aa  1375    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  43.05 
 
 
654 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  42.38 
 
 
652 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  42.11 
 
 
654 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  41.65 
 
 
652 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  39.16 
 
 
669 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  35.47 
 
 
422 aa  241  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  31.83 
 
 
683 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  31.73 
 
 
684 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  31.85 
 
 
690 aa  223  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  31.94 
 
 
681 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  30.81 
 
 
682 aa  221  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  31.87 
 
 
683 aa  216  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  31.77 
 
 
688 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  31.77 
 
 
688 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  31.68 
 
 
636 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  31.22 
 
 
684 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  29.48 
 
 
667 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  30.95 
 
 
709 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  31.18 
 
 
740 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  28.24 
 
 
751 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  31.09 
 
 
689 aa  204  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  31.6 
 
 
680 aa  204  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  30.97 
 
 
679 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  30.66 
 
 
645 aa  200  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  27.91 
 
 
658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  30.91 
 
 
687 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  28.36 
 
 
726 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  32.15 
 
 
765 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  31.83 
 
 
754 aa  197  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  30.56 
 
 
727 aa  194  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  29.18 
 
 
715 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  31.45 
 
 
677 aa  190  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  28.36 
 
 
703 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  29.68 
 
 
685 aa  180  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  28.65 
 
 
713 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  27.05 
 
 
623 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  31.09 
 
 
692 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  28.5 
 
 
615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  27.5 
 
 
714 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  28.18 
 
 
709 aa  174  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  27.79 
 
 
694 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  27.35 
 
 
709 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  28.83 
 
 
708 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  27.91 
 
 
654 aa  171  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  27.62 
 
 
714 aa  167  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  27.58 
 
 
694 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  28.25 
 
 
706 aa  163  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  28.25 
 
 
706 aa  163  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  28 
 
 
714 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  27.87 
 
 
687 aa  160  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  26.92 
 
 
716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  27.44 
 
 
717 aa  157  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  27.12 
 
 
703 aa  157  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  26.83 
 
 
687 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  28.65 
 
 
713 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  28.03 
 
 
708 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  37.21 
 
 
687 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  28.23 
 
 
712 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  27.47 
 
 
703 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  27.23 
 
 
734 aa  150  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  26.52 
 
 
687 aa  150  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  27.21 
 
 
694 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  27.99 
 
 
706 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  26.19 
 
 
662 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  25.68 
 
 
624 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  25.98 
 
 
711 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  38.81 
 
 
679 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  26.37 
 
 
662 aa  143  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  26.06 
 
 
717 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  32.5 
 
 
624 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  32.61 
 
 
624 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.37 
 
 
690 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  26.88 
 
 
623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  25.88 
 
 
696 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  33.33 
 
 
389 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  32.09 
 
 
626 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  32.09 
 
 
626 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  32.09 
 
 
626 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  26.97 
 
 
606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  26.35 
 
 
528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  27.09 
 
 
607 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  29.34 
 
 
603 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  32.81 
 
 
759 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  31.45 
 
 
624 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  25.77 
 
 
723 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  35.04 
 
 
603 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  29.38 
 
 
729 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  34.89 
 
 
597 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  31.36 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  26.36 
 
 
536 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  26.02 
 
 
577 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  27.5 
 
 
546 aa  114  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3852  hypothetical protein  35.29 
 
 
560 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921055  normal  0.646797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  26.99 
 
 
582 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.59 
 
 
595 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  25.66 
 
 
577 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.83 
 
 
660 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  36.84 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  26.77 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>