More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1527 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  43.61 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40910  LysR family transcriptional regulatory protein  43.89 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  44.06 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  42.64 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  41.45 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  38.08 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  38.08 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  38.08 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  38.08 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  38.08 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  40.41 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  43.68 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  44.06 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  39.93 
 
 		 337 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1922  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  41.33 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.68 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2531  transcriptional regulator, LysR family  41.15 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  42.15 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  40.15 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  37.34 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  39.08 
 
 		 312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  39.86 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  39.86 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  41.18 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  41.85 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  39.86 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.59 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>