More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0508 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
388 aa  813    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.74 
 
 
375 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.68 
 
 
369 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.79 
 
 
388 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.1 
 
 
379 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.49 
 
 
370 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
357 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.79 
 
 
373 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 
377 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
380 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.98 
 
 
394 aa  363  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.72 
 
 
372 aa  363  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.92 
 
 
371 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.23 
 
 
369 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.19 
 
 
372 aa  362  6e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.38 
 
 
373 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
386 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.67 
 
 
373 aa  358  6e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.01 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.74 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.05 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.81 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
370 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.88 
 
 
380 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
370 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.95 
 
 
374 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  47 
 
 
384 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.62 
 
 
380 aa  353  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.26 
 
 
376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.84 
 
 
392 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.12 
 
 
371 aa  352  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.59 
 
 
379 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.59 
 
 
379 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
384 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 
380 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.88 
 
 
380 aa  349  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.88 
 
 
380 aa  349  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.93 
 
 
387 aa  349  5e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.67 
 
 
373 aa  348  9e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.41 
 
 
377 aa  348  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
379 aa  346  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.33 
 
 
382 aa  346  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.26 
 
 
379 aa  345  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.37 
 
 
407 aa  345  7e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.65 
 
 
677 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.62 
 
 
379 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.62 
 
 
367 aa  343  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.53 
 
 
365 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.14 
 
 
374 aa  343  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 
372 aa  342  5e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.77 
 
 
379 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  46 
 
 
336 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.77 
 
 
379 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.19 
 
 
679 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.71 
 
 
400 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.04 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.03 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
369 aa  339  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  339  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  339  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
379 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.31 
 
 
375 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
369 aa  338  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  45 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.55 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
377 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.24 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.63 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.77 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.67 
 
 
678 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.09 
 
 
379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0600679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.63 
 
 
368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.57 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.7 
 
 
379 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.29 
 
 
374 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.29 
 
 
374 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.29 
 
 
374 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.42 
 
 
368 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.88 
 
 
372 aa  334  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.68 
 
 
362 aa  334  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.15 
 
 
395 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
373 aa  333  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0175  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.65 
 
 
381 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.85 
 
 
376 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.97 
 
 
392 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.88 
 
 
726 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.52 
 
 
405 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.95 
 
 
368 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.23 
 
 
368 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.42 
 
 
367 aa  332  6e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1866  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.13 
 
 
380 aa  332  8e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000457262  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.42 
 
 
377 aa  332  9e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.44 
 
 
376 aa  331  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.5 
 
 
388 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.24 
 
 
392 aa  331  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>