More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0712 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.12 
 
 
377 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
377 aa  788    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.19 
 
 
377 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.66 
 
 
379 aa  625  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  78.93 
 
 
376 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.2 
 
 
377 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.4 
 
 
379 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 
376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.33 
 
 
375 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  52 
 
 
377 aa  408  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.1 
 
 
373 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.34 
 
 
376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 
376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.08 
 
 
376 aa  401  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
376 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 
379 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.52 
 
 
373 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  49.87 
 
 
376 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
370 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.01 
 
 
376 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
380 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.64 
 
 
377 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
374 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
370 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
376 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
395 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 
407 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 
379 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.69 
 
 
371 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
370 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 
371 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.97 
 
 
379 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
379 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.39 
 
 
386 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
369 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 
380 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
367 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
374 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
373 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.06 
 
 
380 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.96 
 
 
375 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.74 
 
 
379 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
372 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.89 
 
 
387 aa  380  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
374 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
372 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.87 
 
 
382 aa  381  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
372 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.45 
 
 
380 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
377 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.33 
 
 
384 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
365 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.84 
 
 
370 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.11 
 
 
394 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2187  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.51 
 
 
375 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 
372 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.9 
 
 
379 aa  371  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.41 
 
 
355 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.49 
 
 
380 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.16 
 
 
357 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0019  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
379 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.38 
 
 
382 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.52 
 
 
376 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.47 
 
 
380 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.47 
 
 
380 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 
376 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
376 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
375 aa  362  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
373 aa  362  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.13 
 
 
378 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 
392 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 
373 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  47.3 
 
 
371 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
379 aa  359  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.37 
 
 
336 aa  359  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2247  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.95 
 
 
374 aa  358  8e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
369 aa  358  8e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.28 
 
 
376 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.89 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0133  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954831  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.36 
 
 
387 aa  355  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3071  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.62 
 
 
383 aa  355  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3296  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 
383 aa  356  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
372 aa  355  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3270  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.34 
 
 
379 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756074  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1307  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.89 
 
 
387 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2335  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.76 
 
 
386 aa  355  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.0584055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.34 
 
 
377 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>