231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0391 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0391  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
736 aa  1505    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000910038  hitchhiker  0.000000117936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.04 
 
 
751 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.23 
 
 
767 aa  557  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  39.54 
 
 
763 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.43 
 
 
763 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  39.54 
 
 
763 aa  548  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  37.95 
 
 
749 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.63 
 
 
776 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.43 
 
 
770 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.03 
 
 
792 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  40.49 
 
 
776 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  40.49 
 
 
776 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.71 
 
 
780 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.23 
 
 
790 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.41 
 
 
776 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  40.23 
 
 
776 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.86 
 
 
779 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.74 
 
 
773 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.41 
 
 
756 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.93 
 
 
780 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.21 
 
 
778 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.62 
 
 
741 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  38.49 
 
 
763 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.76 
 
 
764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  37.83 
 
 
760 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.93 
 
 
777 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.87 
 
 
767 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.62 
 
 
781 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.36 
 
 
762 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.7 
 
 
773 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.62 
 
 
775 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.52 
 
 
752 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.77 
 
 
785 aa  505  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.74 
 
 
773 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.78 
 
 
752 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.3 
 
 
773 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.52 
 
 
783 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.42 
 
 
758 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.69 
 
 
745 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.63 
 
 
773 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.28 
 
 
758 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.6 
 
 
780 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.54 
 
 
781 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
773 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.44 
 
 
781 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.48 
 
 
778 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.92 
 
 
764 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.04 
 
 
849 aa  488  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 
756 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.15 
 
 
766 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.23 
 
 
816 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.1 
 
 
758 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.23 
 
 
773 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.27 
 
 
774 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.28 
 
 
852 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.77 
 
 
785 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  36.54 
 
 
824 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.86 
 
 
784 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  36.42 
 
 
786 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  35.23 
 
 
812 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3979  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.67 
 
 
756 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803247  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.32 
 
 
740 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.65 
 
 
818 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  36.15 
 
 
741 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.31 
 
 
770 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1090  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.06 
 
 
755 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.34 
 
 
753 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.11 
 
 
766 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  36.68 
 
 
741 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.38 
 
 
779 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.51 
 
 
838 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.11 
 
 
773 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.71 
 
 
840 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0935  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  39.38 
 
 
741 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.993147  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.2 
 
 
743 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.7 
 
 
978 aa  459  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.01 
 
 
795 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.93 
 
 
793 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.86 
 
 
791 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.79 
 
 
763 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.99 
 
 
736 aa  454  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3753  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.55 
 
 
809 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.25 
 
 
744 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.59 
 
 
775 aa  455  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.51 
 
 
762 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.61 
 
 
777 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.52 
 
 
757 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.61 
 
 
837 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.51 
 
 
840 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  35.07 
 
 
763 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  34.71 
 
 
767 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1668  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.69 
 
 
770 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.34 
 
 
785 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.94 
 
 
740 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50470  hydrogenase maturation carbamoyltransferase, HypF  34.33 
 
 
768 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.597235  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3096  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.05 
 
 
749 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  37.1 
 
 
758 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  34.81 
 
 
719 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  34.3 
 
 
771 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.21 
 
 
763 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>