More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1218 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 500 aa  1009    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.06 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  30.15 
 
 		 497 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.15 
 
 		 519 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  30.96 
 
 		 519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  32.09 
 
 		 609 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  32.15 
 
 		 521 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.62 
 
 		 584 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  29.48 
 
 		 519 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.08 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  30.31 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  28.27 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  29.36 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.95 
 
 		 599 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.36 
 
 		 517 aa  154  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.69 
 
 		 588 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.39 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  29.61 
 
 		 517 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.99 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.36 
 
 		 534 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  31.57 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  31.26 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.15 
 
 		 596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.05 
 
 		 589 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  31.38 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  29.27 
 
 		 517 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.47 
 
 		 598 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.6 
 
 		 589 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.12 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  28.66 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.3 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.17 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.44 
 
 		 493 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  28.06 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.29 
 
 		 598 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.51 
 
 		 598 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.9 
 
 		 596 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  29.48 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.99 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  28.6 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  28.91 
 
 		 586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.12 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  27.95 
 
 		 1005 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.52 
 
 		 596 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.47 
 
 		 596 aa  136  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  30.69 
 
 		 596 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.74 
 
 		 596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.74 
 
 		 596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.74 
 
 		 596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.74 
 
 		 596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.3 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.05 
 
 		 602 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  27.66 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.74 
 
 		 577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.02 
 
 		 523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  27.04 
 
 		 506 aa  134  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.83 
 
 		 597 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  30.53 
 
 		 501 aa  133  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  30.53 
 
 		 510 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  26.85 
 
 		 506 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  31.2 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  27.59 
 
 		 657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2787  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.11 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  27.7 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.43 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.19 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.04 
 
 		 597 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  27.41 
 
 		 506 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  30.92 
 
 		 591 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  27.74 
 
 		 596 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  28.51 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  29.28 
 
 		 925 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.58 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.74 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.66 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  25.45 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.24 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  31.36 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.44 
 
 		 547 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  31.36 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.12 
 
 		 596 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.42 
 
 		 583 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.41 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  26.92 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.04 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  31.16 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2529  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.58 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.48 
 
 		 543 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  29.27 
 
 		 605 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  28.4 
 
 		 586 aa  123  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.55 
 
 		 556 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.51 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  28.03 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2046  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.55 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.302213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  26.78 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.87 
 
 		 578 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.86 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>