290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3961 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3961  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 333 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0697467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4621  pentapeptide repeat-containing protein  93.71 
 
 		 430 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3926  pentapeptide repeat protein  90.88 
 
 		 430 aa  591  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5571  hypothetical protein  89.94 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.422571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.12 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.69 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.69 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  26.77 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  24.9 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25.66 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  23.95 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.64 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  25.71 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 		 264 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  21.93 
 
 		 880 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  24 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  24 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  25.63 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  25.63 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  22.47 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  21.59 
 
 		 877 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  21.59 
 
 		 880 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  21.59 
 
 		 880 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  21.03 
 
 		 485 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 		 635 aa  62  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  21.93 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  21.59 
 
 		 880 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  21.59 
 
 		 880 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  20.98 
 
 		 862 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  22.08 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.31 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  21.23 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.41 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  22.58 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.5 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  22.58 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  25.75 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  25.75 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25.47 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  22.52 
 
 		 844 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  27.51 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  26.97 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  24.02 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  23.7 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  23.05 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  23.92 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  28.07 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 		 607 aa  57  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  20.99 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  21.86 
 
 		 710 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  21.17 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 		 204 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 		 452 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  20.96 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  22.92 
 
 		 734 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  24.45 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1328  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 		 929 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000290536  hitchhiker  0.0000145927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  22.17 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.82 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.82 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.02 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  22.97 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  21.78 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 219 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.5 
 
 		 866 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 		 493 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  22.41 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  25.58 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  23.62 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  21.29 
 
 		 872 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  22.84 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 493 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  23.28 
 
 		 420 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  21.49 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  24.72 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  20.1 
 
 		 453 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  26.61 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  24.72 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  22.49 
 
 		 601 aa  53.5  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  23.11 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  22.12 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  20.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  24.71 
 
 		 189 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  22.12 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  22.12 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>