More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2845 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  51.15 
 
 		 727 aa  705    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 715 aa  1474    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  50.42 
 
 		 722 aa  723    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  30.01 
 
 		 675 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01892  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  204  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 698 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.15 
 
 		 663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.15 
 
 		 663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.93 
 
 		 862 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.99 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.82 
 
 		 659 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.99 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.99 
 
 		 663 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.84 
 
 		 650 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 679 aa  127  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.23 
 
 		 759 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.15 
 
 		 862 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.69 
 
 		 641 aa  126  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 635 aa  121  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.77 
 
 		 661 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.71 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.89 
 
 		 859 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.53 
 
 		 764 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.86 
 
 		 862 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.69 
 
 		 861 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  24.84 
 
 		 751 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  24.84 
 
 		 751 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  24.84 
 
 		 751 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  24.84 
 
 		 751 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  24.57 
 
 		 751 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 759 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 746 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  24.18 
 
 		 857 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 678 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  46.76 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  46.76 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  46.76 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  41.67 
 
 		 656 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  46.76 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.48 
 
 		 676 aa  103  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  36.31 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  24.35 
 
 		 698 aa  103  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.33 
 
 		 633 aa  103  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 627 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 709 aa  101  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.25 
 
 		 867 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 683 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  36.09 
 
 		 655 aa  99.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.75 
 
 		 665 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  37.14 
 
 		 653 aa  99  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.63 
 
 		 665 aa  98.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 617 aa  98.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.63 
 
 		 665 aa  98.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  38.36 
 
 		 665 aa  98.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.46 
 
 		 750 aa  98.2  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.53 
 
 		 739 aa  97.4  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.48 
 
 		 646 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.53 
 
 		 754 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.18 
 
 		 1023 aa  96.3  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 657 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  31.25 
 
 		 696 aa  95.9  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 804 aa  95.1  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  22.51 
 
 		 687 aa  95.5  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 697 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.94 
 
 		 676 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 648 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 699 aa  94.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  36.14 
 
 		 652 aa  93.2  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  35.76 
 
 		 704 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 726 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 637 aa  93.2  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  33.52 
 
 		 696 aa  91.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  34.81 
 
 		 326 aa  92  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  35.4 
 
 		 666 aa  91.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 638 aa  91.3  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  36.25 
 
 		 623 aa  91.3  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  35.09 
 
 		 696 aa  90.9  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 653 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  21.23 
 
 		 627 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 799 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  34.78 
 
 		 666 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  34.78 
 
 		 666 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  34.78 
 
 		 666 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 799 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  34.52 
 
 		 702 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.69 
 
 		 681 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 665 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 613 aa  90.5  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  33.52 
 
 		 695 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  36.09 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 616 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  32.95 
 
 		 696 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.24 
 
 		 613 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.12 
 
 		 656 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 775 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  34.16 
 
 		 666 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>