More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2689 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2689  ABC transporter related  100 
 
 		 354 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0279723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1924  ABC transporter related  55.66 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0792  ABC transporter related  46.7 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2121  ABC transporter related  47.4 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.67463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0213  ATPase  43.6 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 353 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.69 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.95 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  40.41 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  44.53 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.39 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 354 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.8 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  39.02 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  41.36 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  42.17 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.62 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.26 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  38.73 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  40.87 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  40.55 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.44 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  36.36 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  40.19 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.17 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.22 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  38.83 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 		 352 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.03 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  36.55 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  34.59 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  40.06 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  38.44 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  39 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  37.96 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  37.11 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  38.94 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  37.69 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  39.35 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.52 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  40.99 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  45.45 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  38.44 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  40.52 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.5 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 		 354 aa  195  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  36.34 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  38.63 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  37.54 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  42.21 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.42 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  38.03 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  40.06 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.75 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  48.21 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  35.99 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.78 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.85 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  37.39 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  32.51 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.69 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.85 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.85 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  41.25 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.14 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.85 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  37.85 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  39.92 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.85 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  42.97 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  34.12 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  45.31 
 
 		 361 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  43.85 
 
 		 363 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 		 330 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 		 367 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 377 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.71 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>