More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2543 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  50 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.15 
 
 		 326 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  46.15 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  44.17 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 236 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  44.54 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 232 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 230 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  43.93 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  43.7 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  43.7 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  43.7 
 
 		 352 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 229 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 231 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.02 
 
 		 229 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.02 
 
 		 229 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 237 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.97 
 
 		 589 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 		 1274 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 234 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 234 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 234 aa  99  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 234 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5056  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 305 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 236 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 227 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.86 
 
 		 230 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 246 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 257 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 225 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 233 aa  97.1  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 231 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 231 aa  97.1  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2216  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 234 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 234 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_137  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 123 aa  95.9  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 238 aa  95.9  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 232 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  45.45 
 
 		 1278 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 236 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 247 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 1118 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  45.69 
 
 		 240 aa  95.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 273 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  43.97 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1923  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 232 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.02 
 
 		 231 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 233 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.52 
 
 		 354 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.97 
 
 		 231 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 236 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 224 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 228 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  41.18 
 
 		 241 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.02 
 
 		 443 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 224 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 244 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 240 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 246 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 246 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  42.74 
 
 		 234 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 231 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1275  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.48 
 
 		 304 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00827298  normal  0.435617 
 
 
-
 
NC_002936  DET0130  response regulator  45.76 
 
 		 123 aa  93.2  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.88 
 
 		 236 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.02 
 
 		 443 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 249 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>