More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2314 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  100 
 
 
164 aa  333  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  67.33 
 
 
152 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  63.64 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  62 
 
 
150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  57.93 
 
 
154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  55.41 
 
 
152 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  54.61 
 
 
159 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  54.67 
 
 
154 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  55.19 
 
 
156 aa  164  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  54.55 
 
 
170 aa  163  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  51.95 
 
 
154 aa  158  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  48.7 
 
 
185 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  49.65 
 
 
166 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  52.08 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  54.86 
 
 
166 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  48.28 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  46.1 
 
 
185 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  45.45 
 
 
185 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  47.5 
 
 
173 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  48.75 
 
 
167 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.03 
 
 
177 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  44.16 
 
 
167 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  44.81 
 
 
185 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  45.03 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  50.72 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  43.14 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  50.69 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  44.51 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  50.69 
 
 
147 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  46.75 
 
 
171 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  47.06 
 
 
167 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  44.81 
 
 
167 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  44.81 
 
 
167 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  48.97 
 
 
157 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  49.66 
 
 
158 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46 
 
 
181 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  50.34 
 
 
156 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  46.1 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  42.86 
 
 
178 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  47.74 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.04 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  49.66 
 
 
156 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  49.66 
 
 
156 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  49.66 
 
 
156 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  49.66 
 
 
156 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  43.04 
 
 
164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  43.14 
 
 
169 aa  137  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  44.08 
 
 
170 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  44.08 
 
 
170 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  43.31 
 
 
172 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  48.32 
 
 
167 aa  136  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  43.29 
 
 
170 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  45.75 
 
 
171 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  42.48 
 
 
169 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  45.81 
 
 
167 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  45.96 
 
 
158 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  48.97 
 
 
156 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  48.97 
 
 
156 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  44.44 
 
 
167 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  43.31 
 
 
172 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  41.83 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  45.27 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  43.42 
 
 
177 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  41.18 
 
 
169 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  41.18 
 
 
170 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  40.61 
 
 
193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  45.89 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  41.18 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  43.79 
 
 
167 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  41.18 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  48.97 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  41.18 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  41.18 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  41.18 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  42.76 
 
 
191 aa  134  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  133  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  40.52 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  44.59 
 
 
169 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  40.52 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  44.81 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  44.37 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  41.45 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  44.44 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  42.07 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  42.68 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.82 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  43.42 
 
 
167 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  40.24 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  40.24 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  40.24 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.48 
 
 
174 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  42.68 
 
 
169 aa  130  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  39.63 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  43.79 
 
 
167 aa  130  9e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>