60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0567 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0567  TonB family protein  100 
 
 		 182 aa  341  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  44.79 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  44.79 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  41.38 
 
 		 88 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  33.66 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  39.86 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.74 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  36.03 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  34.41 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  31.87 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  36.67 
 
 		 273 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30.85 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  38.2 
 
 		 258 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  32.99 
 
 		 267 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  36.05 
 
 		 315 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  32.99 
 
 		 267 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30.34 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  32.99 
 
 		 267 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  34.69 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  37.5 
 
 		 279 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  31.43 
 
 		 317 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.41 
 
 		 292 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  38.89 
 
 		 366 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  38.89 
 
 		 378 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  30.43 
 
 		 265 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.95 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  33.71 
 
 		 331 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.96 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  27.39 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  35.96 
 
 		 237 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  35.48 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  25.76 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  31.82 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  32.98 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  34.21 
 
 		 451 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  29.25 
 
 		 250 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  40.62 
 
 		 495 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  34.09 
 
 		 266 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  33.33 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  44.07 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  37.5 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  30.69 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  30.69 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1699  TonB-dependent receptor, putative  27.93 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  27.59 
 
 		 393 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  23.26 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  36.92 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  34.09 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  28.24 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.14 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  28.85 
 
 		 342 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  29.55 
 
 		 291 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.92 
 
 		 324 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0855  TonB family protein  37.35 
 
 		 353 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  38.46 
 
 		 411 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.1 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  23.21 
 
 		 268 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  32.95 
 
 		 330 aa  41.2  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  31.94 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.5 
 
 		 248 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>