190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0153 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 352 aa  697    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  58.06 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  59.31 
 
 		 353 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  58.45 
 
 		 353 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  56.69 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  59.03 
 
 		 353 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  52.8 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3154  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.358247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2890  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0610119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  38.17 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.03 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  30.42 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  27.15 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.92 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.13 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.06 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.59 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.59 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.65 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.66 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.66 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.65 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.14 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.86 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.69 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  27.11 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.41 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.51 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.02 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.69 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  37.04 
 
 		 1033 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  34.27 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.91 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  35.17 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.47 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  26.83 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  33.57 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  26.25 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  25.5 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.62 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  29.46 
 
 		 652 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  27.59 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  30.57 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.41 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.77 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  33.64 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  26.98 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25.14 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 316 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.14 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.2 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  29.36 
 
 		 666 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.42 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25.42 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 439 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  23.75 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  27.42 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  25.42 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  25.42 
 
 		 468 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  28.85 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>