More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0995 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  45.59 
 
 
68 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  44.26 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
894 aa  63.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  51.67 
 
 
79 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  46.67 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  36.51 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
839 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  40 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  46.67 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
976 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  41.67 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
925 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
867 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  47.69 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40.32 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  40.68 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  40 
 
 
68 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  43.55 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
859 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40.32 
 
 
67 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  37.7 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  37.7 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  38.71 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  38.46 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06720  copper chaperone  46.67 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00676012  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
63 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
63 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
64 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3957  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.59115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.1 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.1 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  38.46 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
814 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
67 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  35.48 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  39.13 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  41.94 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  39.44 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  40.98 
 
 
742 aa  50.4  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.62 
 
 
833 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
826 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
1182 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
871 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
827 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  37.93 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
739 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.07 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
740 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  36.21 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
833 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>