102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1607 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  45.34 
 
 		 161 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  46.75 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  41.14 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  36.31 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  36.71 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1509  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.57 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0965  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000272777  normal  0.399502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  26.14 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  32.43 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0977  putative signal transduction protein with CBS domains  27.11 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121295  normal  0.444169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0795  CBS domain-containing protein  24.32 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0152604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.14 
 
 		 220 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0728  XRE family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 199 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  25.81 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  34.86 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 300 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.03 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  31.53 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  30.87 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  29.38 
 
 		 380 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.76 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  27.35 
 
 		 640 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  26.39 
 
 		 867 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.13 
 
 		 282 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  25.48 
 
 		 636 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  29.82 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.1 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  27.27 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  25.64 
 
 		 143 aa  44.3  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  29.53 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  26.42 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  26.79 
 
 		 683 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.36 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  27.59 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  29.82 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  38.46 
 
 		 464 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.03 
 
 		 688 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  29.6 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  29.13 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.46 
 
 		 461 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.46 
 
 		 461 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.25 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  29.13 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  25.19 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  25.19 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  25.98 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  24.36 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  24.59 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.25 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  33.93 
 
 		 488 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  25.19 
 
 		 138 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 145 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  25.19 
 
 		 138 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  28.83 
 
 		 340 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  25.19 
 
 		 138 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  27.66 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  34.85 
 
 		 457 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  25.95 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  27.47 
 
 		 211 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  28.21 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  27.04 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  27.62 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  34.85 
 
 		 457 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  28.86 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  30.63 
 
 		 341 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  29.5 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  35.42 
 
 		 282 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.31 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  24.43 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  23.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  24.27 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2604  CBS domain-containing protein  22.45 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019809  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  31.37 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>