More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0963 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0963  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 310 aa  634    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3276  porphobilinogen deaminase  52.12 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5018  porphobilinogen deaminase  52.1 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0492  hydroxymethylbilane synthase  50.66 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  41.61 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  43.51 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  38.71 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  42.63 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  42.35 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  41.56 
 
 		 322 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  43 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  41.75 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  41.75 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  41.69 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  38.59 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  40.89 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  40.39 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  41.04 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  41.1 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  38.71 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  38.26 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  37.38 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  41.29 
 
 		 316 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  36.77 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  39.14 
 
 		 351 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  40.89 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  39.14 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  39.62 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  39.35 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  38.69 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  41.69 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  39.22 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  42.05 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  40.86 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  38.24 
 
 		 309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  38.39 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  39.54 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  36.25 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  36.63 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  39.02 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  38.11 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  36.89 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  38.69 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  38.54 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  38.89 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  38.29 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  37.17 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  37.95 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  39.14 
 
 		 310 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  39.74 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  39.74 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  39.54 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  37.95 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  37.1 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>