102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0231 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  55.81 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  49.6 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  52.46 
 
 
258 aa  241  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  51.64 
 
 
258 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  50.83 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  47.35 
 
 
269 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  49.41 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  47.33 
 
 
258 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  44.44 
 
 
255 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  48.18 
 
 
248 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  49.38 
 
 
248 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  42.64 
 
 
260 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  45.74 
 
 
284 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  48.99 
 
 
248 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  50.62 
 
 
250 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  49.59 
 
 
248 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  49.59 
 
 
248 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  45.49 
 
 
248 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  47.39 
 
 
266 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  46.12 
 
 
249 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  46.99 
 
 
275 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  45.85 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  45.45 
 
 
271 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  40.08 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  40.08 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  39.69 
 
 
267 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  40.08 
 
 
267 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  45.85 
 
 
272 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  40.24 
 
 
260 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  39.68 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  41.76 
 
 
285 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  43.06 
 
 
283 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  39.44 
 
 
266 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  39.04 
 
 
266 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  39.04 
 
 
266 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  45.65 
 
 
281 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  45.65 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  45.65 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  43.07 
 
 
283 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  43.07 
 
 
283 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  43.07 
 
 
283 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  43.07 
 
 
283 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  43.07 
 
 
283 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  43.07 
 
 
283 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  44.62 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  41.2 
 
 
268 aa  185  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  43.85 
 
 
250 aa  185  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  45.97 
 
 
251 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  40.8 
 
 
258 aa  184  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  38 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  47.77 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  41.7 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  43.48 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  43.12 
 
 
281 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  39.2 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  41.27 
 
 
253 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  43.91 
 
 
281 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  43.84 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  39.86 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  37.86 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  41.94 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  41.04 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  41.7 
 
 
272 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  41.02 
 
 
248 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  38.67 
 
 
258 aa  168  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  40.32 
 
 
319 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  40.91 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  41.74 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  42.36 
 
 
257 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  36.9 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  35.52 
 
 
274 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  35.8 
 
 
278 aa  135  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  37.76 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  33.82 
 
 
294 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  36.59 
 
 
232 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  33.53 
 
 
179 aa  96.3  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  30.19 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  26.1 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  30.31 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  35.92 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  30.38 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  37.09 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  31.93 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  29.1 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  28.28 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  35.53 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  33.96 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  28.28 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  33.8 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  38.71 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  30.67 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06058  DUF833 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09530)  28.31 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.695721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  33.08 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  30.06 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  44.29 
 
 
270 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  30.87 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  32.45 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>