101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0148 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
495 aa  1012    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  28.19 
 
 
485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  29.26 
 
 
478 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  27.89 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.79 
 
 
484 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  27.11 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  26.32 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 
515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  42.04 
 
 
515 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  42.04 
 
 
515 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  43.95 
 
 
515 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  45.74 
 
 
510 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  22.41 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.57 
 
 
1305 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  30.67 
 
 
280 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  35.65 
 
 
523 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 
528 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 
523 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  28.91 
 
 
559 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  31.5 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.06 
 
 
282 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 
453 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 
391 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 
391 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  41.03 
 
 
517 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  31.9 
 
 
500 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  30.63 
 
 
634 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 
271 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.4 
 
 
327 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  31.93 
 
 
288 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.59 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  26.89 
 
 
272 aa  53.5  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
376 aa  53.5  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  38.46 
 
 
634 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  29.55 
 
 
204 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  38.04 
 
 
634 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  27.74 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  29.59 
 
 
321 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 
792 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  35.87 
 
 
635 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  27.03 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.92 
 
 
271 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  35.71 
 
 
633 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  33.68 
 
 
211 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.49 
 
 
316 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  40 
 
 
616 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
366 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  27.69 
 
 
216 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  38.96 
 
 
639 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  35.71 
 
 
641 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 
278 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  34.71 
 
 
268 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  30 
 
 
266 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.38 
 
 
279 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.38 
 
 
279 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.38 
 
 
279 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  30.5 
 
 
265 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  36.36 
 
 
632 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  28.78 
 
 
336 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  32.33 
 
 
269 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 
438 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
261 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  28.06 
 
 
336 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  31.82 
 
 
286 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  34.78 
 
 
638 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  33.66 
 
 
631 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
914 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 
337 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 
438 aa  47.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  30 
 
 
282 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  29.79 
 
 
744 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  27.46 
 
 
267 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.48 
 
 
762 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  34.67 
 
 
453 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  24.53 
 
 
637 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  29.3 
 
 
298 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  30.71 
 
 
200 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  23.26 
 
 
571 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  34.44 
 
 
633 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  28.57 
 
 
266 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  29.91 
 
 
373 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 
317 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  27.42 
 
 
338 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  28.23 
 
 
282 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 
286 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  33.7 
 
 
638 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 
260 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  27.05 
 
 
284 aa  44.3  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  31.86 
 
 
269 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 
298 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
257 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  31.58 
 
 
220 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 
286 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 
266 aa  43.9  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  27.39 
 
 
277 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  35.92 
 
 
263 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2238  transglutaminase domain protein  27.44 
 
 
862 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>