More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2548 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  52.16 
 
 
232 aa  258  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  54.78 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 
232 aa  224  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  45.89 
 
 
232 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
233 aa  218  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
232 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 
232 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 
232 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 
232 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 
232 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 
232 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
236 aa  209  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  42.6 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  41.15 
 
 
227 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  40.69 
 
 
233 aa  191  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  42.22 
 
 
230 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0632  ABC transporter related  44.93 
 
 
228 aa  184  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  38.43 
 
 
232 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  37.89 
 
 
228 aa  181  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  39.47 
 
 
234 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  39.55 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
229 aa  168  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  35.78 
 
 
232 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0794  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
230 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
236 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  36.04 
 
 
226 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  36.36 
 
 
243 aa  154  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 
283 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 
283 aa  151  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  32.76 
 
 
232 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  36.11 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
341 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  36.15 
 
 
264 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
285 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
294 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  34.65 
 
 
273 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  35.48 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.25 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.16 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  32.9 
 
 
250 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  33.78 
 
 
309 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  34.56 
 
 
296 aa  138  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
332 aa  138  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  33.79 
 
 
305 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  34.84 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  30.73 
 
 
308 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  31.65 
 
 
316 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 
319 aa  134  9e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  30.36 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  31.14 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  31.6 
 
 
287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.4 
 
 
324 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  32.71 
 
 
298 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  31.11 
 
 
309 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2003  ABC transporter  33.63 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.19 
 
 
302 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  35.4 
 
 
303 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 
291 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.28 
 
 
302 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  31.65 
 
 
313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  31.65 
 
 
313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  31.65 
 
 
313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  29.36 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  31.16 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.25 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.79 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  32.24 
 
 
306 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  29.73 
 
 
342 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  30.87 
 
 
340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 
309 aa  128  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  28.88 
 
 
297 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  29.86 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  32.91 
 
 
240 aa  128  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  30.8 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  33.48 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  33.33 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.8 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  30.41 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  33.93 
 
 
285 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 
308 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  32.74 
 
 
305 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  28.14 
 
 
300 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  30.63 
 
 
306 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2234  ABC transporter related  34.06 
 
 
231 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  30.56 
 
 
308 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  30.84 
 
 
300 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  33.19 
 
 
298 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  30.6 
 
 
307 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  29.3 
 
 
247 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>