More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2234 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2234  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  38.86 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  40 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  37.12 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  37.99 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  34.06 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  33.33 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  37.07 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  35.56 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  37.78 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  36.04 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  33.77 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0632  ABC transporter related  37.67 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  31.82 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  28.57 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  30.87 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  33.18 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  33.18 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  30.29 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  31.6 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  33.02 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  29.82 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  32.73 
 
 		 299 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  28.23 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  29.17 
 
 		 319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.22 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  26.67 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  35.57 
 
 		 304 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.12 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  30.47 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2003  ABC transporter  32.08 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34.19 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  31.22 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 288 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 288 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.19 
 
 		 302 aa  108  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  32.34 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  33 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  34.34 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  31.1 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  32.17 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  27.65 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  33.5 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  27.11 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  27.91 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.64 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  29.72 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  31.58 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  26.22 
 
 		 306 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  32.63 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  30.14 
 
 		 293 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  28.83 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  28.37 
 
 		 314 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  31.25 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  33.49 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0349  ABC transporter related  33.04 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.87 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 293 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  28.33 
 
 		 335 aa  104  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  29.36 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  28.77 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  33.33 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  32.61 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  25.45 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  31.88 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  27.67 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  30.99 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  26.54 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  30.32 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2589  ABC transporter related  27.83 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2537  ABC transporter related  27.83 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  29.7 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  31 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  27.88 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  33.5 
 
 		 293 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>