More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2003 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2003  ABC transporter  100 
 
 		 230 aa  453  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  40.09 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  40.97 
 
 		 232 aa  167  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  37 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  34.51 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  33.77 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  34.96 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  32.3 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  34.86 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  33.91 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  34.21 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  30.18 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  34.22 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  30.09 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 		 293 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  32.87 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  34.21 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  31.19 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 		 293 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 293 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  30.1 
 
 		 313 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  31.46 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  31.72 
 
 		 273 aa  124  9e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  31.48 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  31.48 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  30.09 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 285 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 		 293 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  30.33 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  29.6 
 
 		 307 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  28.51 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  28.96 
 
 		 292 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  32.39 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  32.09 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  29.19 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 308 aa  121  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 299 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  30.7 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  32.24 
 
 		 296 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  31.11 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  32.5 
 
 		 293 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  29.58 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  33 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  28.78 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  29.49 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  29.19 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  27.85 
 
 		 305 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2229  ABC transporter related  30.87 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  28.18 
 
 		 406 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  27.71 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  26.87 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  29.82 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 293 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  29.03 
 
 		 290 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  32.52 
 
 		 283 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  30.91 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  27.19 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  28.51 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  28 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  31.19 
 
 		 306 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0632  ABC transporter related  35.14 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  30.69 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  30.7 
 
 		 309 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  27.16 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  33.18 
 
 		 290 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  30.09 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  29.77 
 
 		 316 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  29.3 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  29.3 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 541 aa  116  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  29.15 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 287 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  30.46 
 
 		 299 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  28.31 
 
 		 306 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2724  ABC transporter related protein  28.44 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.82 
 
 		 302 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  29.67 
 
 		 293 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  27.23 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>