More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1864 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  63.59 
 
 
199 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  57.35 
 
 
204 aa  260  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  53.47 
 
 
212 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.23 
 
 
203 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  50.5 
 
 
205 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  50.25 
 
 
209 aa  215  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  48.73 
 
 
200 aa  208  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  48.72 
 
 
202 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  46.67 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
207 aa  193  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  46.11 
 
 
221 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  46.11 
 
 
221 aa  188  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 
221 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  43.68 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  43.68 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  43.68 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  43.68 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  43.68 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  43.02 
 
 
198 aa  140  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  38.76 
 
 
212 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  37.24 
 
 
196 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0446  ABC transporter related  34.09 
 
 
264 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.051216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  35.44 
 
 
543 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
230 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  37.81 
 
 
256 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  34.95 
 
 
543 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  33.49 
 
 
254 aa  122  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  32.88 
 
 
239 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  32.81 
 
 
329 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  32.54 
 
 
233 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  32.54 
 
 
233 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.39 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  32.86 
 
 
254 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.69 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.69 
 
 
337 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 
539 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.81 
 
 
298 aa  117  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  35.75 
 
 
340 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2273  nickel transporter ATP-binding protein NikE  33.98 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  31.7 
 
 
566 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.22 
 
 
323 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0160  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 
320 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1514  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1220  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.85 
 
 
349 aa  116  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.585278  normal  0.0173539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  31.55 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
547 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4733  ABC transporter, ATPase subunit  32.13 
 
 
262 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.497706  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.16 
 
 
336 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  34.47 
 
 
543 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  33.33 
 
 
572 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  31.22 
 
 
268 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  34.15 
 
 
532 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.02 
 
 
566 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 
320 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  35.15 
 
 
257 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  31.58 
 
 
571 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  33.51 
 
 
208 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 
257 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 
257 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
220 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 
257 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
524 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 
257 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
337 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0179  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 
257 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 
257 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  32.7 
 
 
249 aa  114  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  31.86 
 
 
268 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  31.86 
 
 
268 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0235  nickel import ATP-binding protein NikE  30.77 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1825  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.84 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  34.87 
 
 
550 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  35.05 
 
 
541 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  34.15 
 
 
549 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  31.86 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  31.86 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  33.66 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 
571 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.29 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0457  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.29 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  31.86 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  32.82 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0800  nickel transporter ATP-binding protein NikE  35.78 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 
343 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.752821  normal  0.689608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  31.51 
 
 
322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1796  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.69 
 
 
338 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.749198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.67 
 
 
318 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  32.39 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.64 
 
 
558 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 
572 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  33.85 
 
 
592 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 
571 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>