More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0800 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0800  nickel transporter ATP-binding protein NikE  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306666  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0750  nickel transporter ATP-binding protein NikE  99.62 
 
 
266 aa  527  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7618  nickel transporter ATP-binding protein NikE  64.09 
 
 
264 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2273  nickel transporter ATP-binding protein NikE  57.69 
 
 
277 aa  288  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  54.02 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  54.02 
 
 
268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  54.02 
 
 
268 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  54.02 
 
 
268 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  54.02 
 
 
268 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  54.02 
 
 
268 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0235  nickel import ATP-binding protein NikE  53.64 
 
 
268 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3841  nickel transporter ATP-binding protein NikE  53.26 
 
 
268 aa  279  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4820  nickel transporter ATP-binding protein NikE  52.49 
 
 
268 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  53.64 
 
 
268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6072  ABC transporter related  50.19 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3009  nickel transporter ATP-binding protein NikE  46.95 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.208054  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3346  nickel transporter ATP-binding protein NikE  46.74 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.9 
 
 
549 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.66 
 
 
546 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.47 
 
 
327 aa  204  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  45.73 
 
 
332 aa  203  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  45.73 
 
 
332 aa  203  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0347  ABC transporter related  40.61 
 
 
320 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  48.29 
 
 
586 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.55 
 
 
366 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2398  ABC transporter related  45.61 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.4 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 
321 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  42.02 
 
 
571 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
326 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0032  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
346 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
276 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
329 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.8 
 
 
313 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 
338 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1594  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 
441 aa  191  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  41.09 
 
 
282 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 
321 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.19 
 
 
364 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 
336 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.68 
 
 
323 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7775  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 
419 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
362 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  46.58 
 
 
544 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  49.32 
 
 
540 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  41.41 
 
 
619 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.37 
 
 
318 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  41.38 
 
 
310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  47.01 
 
 
544 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.62 
 
 
337 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2644  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.23 
 
 
322 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.277235  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 
736 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  42.65 
 
 
629 aa  189  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0636  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
322 aa  188  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  48 
 
 
338 aa  188  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0554278  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 
320 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.43 
 
 
355 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
349 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 
339 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3644  ABC transporter related  46.41 
 
 
265 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
321 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
328 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84761  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 
336 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  45.8 
 
 
540 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 
326 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.43 
 
 
343 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  45.8 
 
 
540 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.81 
 
 
332 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 
320 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  40 
 
 
573 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
594 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0879  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.65 
 
 
436 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
311 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 
320 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 
344 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  45.85 
 
 
578 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1078  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
334 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7207  ABC transporter  44.89 
 
 
344 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
339 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.86 
 
 
619 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1796  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 
338 aa  185  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.749198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2960  ABC transporter related  40.32 
 
 
265 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.97 
 
 
703 aa  185  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
388 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 
307 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2754  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.66 
 
 
327 aa  184  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  43.08 
 
 
311 aa  184  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5117  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
279 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.889797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>