137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0717 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 393 aa  802    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  62.6 
 
 		 392 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  47.46 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  39.77 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  33.93 
 
 		 373 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  32.63 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  33.33 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  32.4 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  31.54 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  30.67 
 
 		 969 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  30.39 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  30.49 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  30.05 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  31.48 
 
 		 572 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  30.5 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  30.16 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  29.78 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  25.78 
 
 		 382 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  25.56 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  28.42 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  26.96 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.65 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  28.92 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.13 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.54 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 726 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  25.13 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  30.05 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  23.58 
 
 		 638 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.71 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  27.27 
 
 		 687 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  36.96 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25 
 
 		 178 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  26.84 
 
 		 715 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  22.22 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  27.37 
 
 		 715 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.36 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 713 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  31.4 
 
 		 173 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  31.4 
 
 		 173 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 703 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  26.34 
 
 		 788 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  28.88 
 
 		 749 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.32 
 
 		 229 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  27.7 
 
 		 787 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  27.85 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  27.7 
 
 		 763 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  30.96 
 
 		 701 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2637  FMN-binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 758 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32 
 
 		 211 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  31.85 
 
 		 206 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  26.58 
 
 		 625 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  27.71 
 
 		 714 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.59 
 
 		 200 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.54 
 
 		 185 aa  49.7  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  27.16 
 
 		 764 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 184 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  23.68 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  30.16 
 
 		 168 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  25.15 
 
 		 189 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 184 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  28.69 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  35.48 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.58 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.85 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  31.85 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  31.85 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  31.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  32.17 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  31.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  31.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.81 
 
 		 190 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.59 
 
 		 220 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  28.33 
 
 		 704 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  31.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  35.44 
 
 		 171 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.01 
 
 		 298 aa  47  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  28.7 
 
 		 181 aa  46.2  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  35.53 
 
 		 173 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.67 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.4 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  29.27 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  29.27 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  29.17 
 
 		 214 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  29.27 
 
 		 208 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  26.8 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  25.83 
 
 		 716 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  26.05 
 
 		 708 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.71 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.78 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  29.69 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  27.97 
 
 		 699 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  27.27 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  33.33 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>