140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1958 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  56.99 
 
 
191 aa  204  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  55.67 
 
 
192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0583  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  56.99 
 
 
192 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  46.07 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2828  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.75 
 
 
196 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.061366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  38.64 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0063  FMN-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
230 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.650559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.42 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.49 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.61 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.61 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.11 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.56 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.72 
 
 
344 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  37.9 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.52 
 
 
219 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.52 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.1 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.58 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  34.21 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  36.36 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.03 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.27 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  39.13 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.25 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.13 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.31 
 
 
368 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  28.35 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  36.11 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  31.88 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  35.78 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  35.78 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.36 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  35.78 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.17 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  33.74 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  34.68 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  37.61 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  32.75 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  32.75 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  37.61 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  37.61 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  32.75 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  37.76 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  37.61 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  32.75 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  33.33 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.25 
 
 
215 aa  62  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  32.16 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  34.51 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  31.51 
 
 
212 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  33.87 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  40.95 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.95 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.54 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.78 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.31 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  37.93 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  28.65 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  40.95 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  40.95 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  42.11 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  42.11 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  30.47 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.89 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.98 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  42.11 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  42.11 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.77 
 
 
222 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.46 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  32.26 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.15 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.48 
 
 
222 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  40 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  28.49 
 
 
185 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.65 
 
 
210 aa  57.8  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.1 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  34.45 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  36.44 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  36.44 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  36.44 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.25 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  32.79 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  32.2 
 
 
209 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  29.37 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.67 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  31.85 
 
 
257 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  38.54 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  33.33 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  37.23 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  37.4 
 
 
230 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.56 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  29.55 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  29.61 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  40.23 
 
 
373 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.09 
 
 
580 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  28.73 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.33 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>