215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0687 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0687  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
228 aa  460  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.9 
 
 
231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2618  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.75 
 
 
228 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  38.39 
 
 
232 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.11 
 
 
232 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.25 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2946  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.87 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.78 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.26 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  30.26 
 
 
352 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.71 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.38 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.95 
 
 
198 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.49 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.28 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.62 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.24 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.24 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2755  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.33 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.29 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.6 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.99 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.86 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.55 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.33 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.63 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  26.24 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.5 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.25 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.81 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  17.62 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.81 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  17.82 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.81 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.63 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.28 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.21 
 
 
225 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.28 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.63 
 
 
224 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  23.28 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.81 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.98 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.14 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0681  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0670228  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  22.95 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.61 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.74 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.51 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  19.15 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.03 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1971  transcriptional regulator  22.8 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.95 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.83 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.7 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.5 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.58 
 
 
225 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>