More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0380 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
184 aa  85.5  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  34.93 
 
 
187 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
141 aa  77  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  33.96 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  34 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  37.86 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  28.87 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  27.71 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0230  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
158 aa  72  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
187 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  30.56 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  29.33 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
133 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
174 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.06 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.74 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  32.29 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.59 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  34.17 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  51.67 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  33.33 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.59 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.97 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.48 
 
 
345 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.59 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.59 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  29.25 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  26.6 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  26.6 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
137 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.59 
 
 
345 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
161 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 
271 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 
473 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  35.19 
 
 
153 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>