253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0320 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0320  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
469 aa  978    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24920  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  41.18 
 
 
460 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.852439  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1944  aminomethyltransferase, putative  33.33 
 
 
425 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000857452 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6553  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.12 
 
 
467 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0277028  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0192  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.88 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000184996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1565  aminomethyltransferase  29.72 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.287343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0209  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.07 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000425405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33030  aminomethyltransferase  28.71 
 
 
450 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2404  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.12 
 
 
462 aa  150  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11650  aminomethyltransferase  27.79 
 
 
466 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2861  aminomethyltransferase  28.05 
 
 
466 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5560  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  27.34 
 
 
472 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.75 
 
 
400 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1847  aminomethyltransferase, putative  39.85 
 
 
131 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.16 
 
 
767 aa  80.1  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.97 
 
 
752 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.95 
 
 
790 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.35 
 
 
789 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.74 
 
 
781 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  25.24 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0949  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.02 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  24.43 
 
 
977 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1843  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  22.57 
 
 
757 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.33 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  25.89 
 
 
955 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  25.44 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  21.55 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.33 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.29 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  23.91 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.98 
 
 
789 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  24.91 
 
 
1002 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.59 
 
 
789 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.06 
 
 
993 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  23.78 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.22 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.08 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.27 
 
 
925 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  25 
 
 
1008 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.41 
 
 
988 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.71 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.4 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.4 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  24.54 
 
 
889 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  24.54 
 
 
1002 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.4 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.3 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.4 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.37 
 
 
974 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  24.54 
 
 
1002 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  24.54 
 
 
1002 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.55 
 
 
370 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  23.99 
 
 
1000 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.99 
 
 
1000 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.4 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.4 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  22.83 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  21.08 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.4 
 
 
366 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  25 
 
 
993 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.12 
 
 
1009 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.26 
 
 
984 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.99 
 
 
1003 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25 
 
 
993 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  26.37 
 
 
965 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.07 
 
 
1003 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.43 
 
 
357 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.73 
 
 
999 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  28.05 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.27 
 
 
967 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  28.71 
 
 
984 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.92 
 
 
772 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.32 
 
 
857 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  23.77 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  28.98 
 
 
937 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.39 
 
 
1003 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  22.68 
 
 
361 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  26.37 
 
 
968 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  23.94 
 
 
961 aa  64.3  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.14 
 
 
378 aa  64.3  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  22.92 
 
 
364 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  24.57 
 
 
1003 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.81 
 
 
366 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.62 
 
 
1003 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.13 
 
 
1009 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  22.71 
 
 
1003 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  22.71 
 
 
1003 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  22.71 
 
 
1003 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.01 
 
 
1009 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  25 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  24.25 
 
 
371 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.37 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  28.8 
 
 
997 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  24.55 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.62 
 
 
366 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  22.85 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  22.85 
 
 
442 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.32 
 
 
995 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>