204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2583 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  100 
 
 		 84 aa  174  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  50 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  43.59 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  47.37 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  43.66 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  42.19 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  40.91 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  40.91 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  41.67 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  42.65 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  35.8 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  43.94 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  41.67 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  41.94 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  38.16 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  41.82 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  34.78 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.62 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.1 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  37.5 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  40.58 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.29 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  39.06 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  36.36 
 
 		 398 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  33.75 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  39.39 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  41.38 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.33 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  33.75 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  39.39 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.39 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  37.21 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  39.02 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  38.96 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  32.73 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  39.13 
 
 		 221 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  36.49 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  36.49 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  46.81 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  31.43 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  36.76 
 
 		 260 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  37.68 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  40.98 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  39.13 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1309  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1109  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1091  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1085  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  36.9 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1097  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1270  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1347  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0109883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1200  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.5 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  37.04 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1242  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0702  transcriptional regulator Spx  39.02 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  37.68 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  36.9 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  38.81 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  36.9 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  39.71 
 
 		 402 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  36.9 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  36.9 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  36.9 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  35.14 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4100  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0904  transcriptional regulator Spx  40.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.873656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.65 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  51.35 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.32 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  32 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  54.05 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  35.71 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  37.21 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  33.78 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  29.41 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>