More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1930 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 151 aa  293  8e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  36.97 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.01 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.01 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.54 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  37.82 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.59 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.14 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.59 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  36.29 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  35.16 
 
 		 315 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  36.29 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.62 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  34.97 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  40.21 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  36.45 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  36.94 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  37.69 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  32.46 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.3 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  37.82 
 
 		 313 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  37.39 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.59 
 
 		 318 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  37.39 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  36.47 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  31.58 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.96 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.92 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  48.15 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  35 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  36.26 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  36.26 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  36.26 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.26 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  27.07 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  32.26 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  33.33 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  48 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  33.8 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  34.27 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.96 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.26 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.46 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.07 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  37.04 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.96 
 
 		 347 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1070  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000247956  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.07 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.78 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.16 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  44.26 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  44.26 
 
 		 314 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>