112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1366 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1366  putative prophage repressor  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.291481  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  40.25 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  35.11 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  26.7 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  27.19 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  27.19 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  27.19 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  36.13 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  36.97 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  27.15 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  36.61 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.01 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  36.61 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  34.17 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  34.17 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  32.76 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  32.76 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  32.76 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.33 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  33.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.17 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  24.75 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  31.4 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  29.84 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  35.34 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  32.23 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  27.33 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  29.27 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  31.9 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  33.64 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  30.16 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  32.76 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.47 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  27.92 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  33.33 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  29.27 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  29.27 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  31.97 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  24 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0487  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  26.83 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  35.56 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  32.31 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  33.04 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.25 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  24.26 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3567  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.398908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 104 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  30.71 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  29.01 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.42 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.37 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0497  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00160476  normal  0.0662624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  29.6 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  33.04 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  32.2 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  31.09 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  32.74 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  24.66 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  27.89 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  29.01 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  32.76 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.78 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.27 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0518  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.37 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  23 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.69 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  30.3 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  28.93 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  30.14 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  33.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  27.91 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 81 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  31.86 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  31.86 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.97 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  28.57 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 230 aa  42  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04014  LexA repressor  31.3 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  28.68 
 
 		 202 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  24.59 
 
 		 207 aa  42  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  29.14 
 
 		 239 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  30.97 
 
 		 202 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>