More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0432 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  100 
 
 		 449 aa  903    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  41.2 
 
 		 407 aa  295  8e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  41.08 
 
 		 403 aa  270  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.99 
 
 		 426 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.28 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.11 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.49 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  29.79 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  30.73 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29.78 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  30.46 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  28.12 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  27.07 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  31.65 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  29.13 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.53 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  27.94 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  29.06 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  27.98 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  30.88 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  27.38 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  29.57 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  29.17 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.83 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  26.24 
 
 		 438 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  27.53 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  30.39 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  30.17 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  26.92 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  28.73 
 
 		 428 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  29.32 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  27.27 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  29.32 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  28.18 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.02 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  29.32 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  27.74 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  29.24 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  27.8 
 
 		 483 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  27.38 
 
 		 507 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  27.53 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  27.53 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  29.17 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  27.53 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  28.75 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  27.27 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  27.27 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  27.27 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  27.27 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  27.27 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  27.27 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.29 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  28.99 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.29 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  28.99 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  27.54 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  24.56 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  29.2 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  28.71 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  27.45 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  25.18 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.47 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  25.7 
 
 		 466 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  24.83 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  25.98 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  28.16 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  29.93 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  27.03 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  28.17 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  26.86 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  25.31 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  26.77 
 
 		 460 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  27.16 
 
 		 443 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  27.94 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  26.51 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  27.2 
 
 		 484 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  28.89 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  23.23 
 
 		 430 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  26.47 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  26.65 
 
 		 519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  26.01 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  26.32 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  27.41 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  28.17 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  28.69 
 
 		 506 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  25.6 
 
 		 447 aa  114  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.48 
 
 		 435 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  26.28 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  26.25 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  28.67 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  25.38 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  28.67 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.73 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  27.89 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  26.14 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  25.78 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  26.08 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  26.93 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.39 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>